船團是帳號，船團名稱即是帳號名稱。

船團是包含提督與航海士、船隻在內的整體艦隊，是玩家的基本單位。

船團等級包括提督的成長、航海士的成長等，是玩家所有活動累積的標準。船團等級越高，提督可指揮的船隻數越多，整體艦隊規模也會擴大。行動力持有量增加後，便可進行提督命令、探索部落等各種玩法。

船團等級1至等級30可享有新手優惠。優惠會隨著船團等級提升而減少。可透過[成長關鍵]活動獲得各種成長優惠。

可透過[選單] - [管理船團] - [船團資訊]查看船團的整體資訊。

可查看船團名稱與船團等級、目前任命的提督，也可掌握目前船團等級享有的優惠與運用艦隊狀況、資產管理狀態、資助契約狀態。一併顯示所屬國家與屬性、船團獲得的各種正面與負面效果。

免稅證：可查看船團持有的免稅證與關稅效果。若有免稅證，貿易時可減免部分關稅。可於各國的[大本營] - [王宮]使用藍鑽購買免稅證。

委任副官：可選擇離線航海中交戰或發生災害時，副官的應對方式。委任副官的功能可以開關。

旗艦至少要有老舊的副官室才能委任副官，否則將無法使用委任副官功能。

在大航海時代：起源中，若開啟自動航海，便可在離線持續航行至目的地。在離線航海中，若發生海上災害或需要積極應對敵人突襲的活動時，會依照玩家在[委任副官]中預先設定的方針行動。

藉著可積極應對災害與突襲戰鬥的功能，讓玩家享受更安全的航海。

開始遊戲時選擇第一位提督後，玩家的船團將以提督所屬國家展開遊戲。

遊戲中玩家進行的所有活動，如整合投資、攻擊任一國籍船隻、擊退海盜活動聲譽，或與特定國家的友好度等，都會以船團為單位獲得評價。

與國家的聲譽數值可使船團於該國享有優惠，反之也可能遭受損失。尤其長時間隸屬特定國家，獲得爵位晉升而威名遠播，或於特定國家聲譽急遽下滑時，將可能遭受敵對國家攻擊。

可透過移民移轉至其它國家。移民時，於先前國家獲得的爵位與優惠將全部消失。

若要移民，需在欲移民前往的國家取得20%以上的聲譽。無法移民至國力前3名的國家，各國也有可能暫時不接受移民。

以遊戲正式營運時的情況為準，可選擇葡萄牙、西班牙、英格蘭、尼德蘭、鄂圖曼等5國。另外可透過移民移轉至明、朝鮮、日本等國。此外目前版本也有法蘭西、普魯士、教宗國等NPC國家。

所有玩家可依據自己遊戲風格，於冒險、貿易、戰鬥3種中選擇合適的船團屬性。

開始遊戲時，玩家將透過教學決定最初的船團屬性，之後將按照所選擇的屬性提供每日任務。船團屬性會影響船團可透過任務獲得的主要獎勵。也會影響工會生成的委託範疇與內容。

變更船團屬性後若要再次變更，需要等待24小時。

顯示影響船團的正面與負面效果。

可得知目前船團獲得的所有效果。

此處顯示各國任務、航海中發生的增益與減益、各種災害效果、各種新手優惠與套用的庇護等資訊。

善惡系統是在大航海時代：起源中，攻擊其他玩家的船團或掠奪村莊時會增加的數值。

如果累積了善惡將會受到影響遊戲的懲罰，在普通海域可能會遭受攻擊，或增加遭受強襲的機率和特定災害發生的機率。

在航海或城市皆可透過船團名稱的顏色來分辨船團累積的善惡，數值高越顏色則會越紅。但是攻擊下列顏色的船團時並不會增加善惡數值。

例如：犯人等級1、犯人等級2、犯人等級3、叛徒。

原則上善惡數值會隨著時間而減少，討伐海盜時也會減少一定的數值。

可於戰鬥前設定陣形。可於[選單] - [艦隊] - [編制]設定陣形。

依據陣形決定戰鬥開始時的船隻配置，配置於前列、中列、後列的船隻套用的附加效果不同。

遊戲初始提供基本陣形，可消耗財物開放與使用追加陣形。

屬性	陣形	效果
基本陣形		可於任何情況套用的陣形 前列：砲擊防禦力+5%。 中列：砲擊命中+5%。 後列：肉搏攻擊力+5%。
切斷退路		適用包圍並殲滅敵人的陣形 前列：肉搏命中+5%。 中列：肉搏命中+5%。 後列：砲擊命中+5%。
後方集結		於後方集結，使敵人攻擊無效的特化陣形 前列：衝破防禦力+ 5% 。 中列：砲擊攻擊力+5%。 後列：機動力+10%。
高貴的團結		以高機動力壓制敵人的陣形 前列：機動力+10%。 中列：機動力+10%。 後列：機動力+10%。
迅速砲擊		適合在敵人接近前採取砲擊的陣形 前列：機動力+10%。 中列：砲擊攻擊力+5%。 後列：砲擊防禦力+5%。
勇猛的進攻		適合快速接近敵人，採取肉搏攻擊的陣形 前列：機動力+10%。 中列：肉搏防禦力+5%。 後列：肉搏攻擊力+5%。
殘酷的突破		適合對靠近的敵人採取衝破攻擊的陣形 前列：機動力+10%。 中列：衝破攻擊力+ 5% 。 後列：衝破防禦力+ 5% 。
火力集中		給予敵人致命傷害的特化陣形 前列：百人致命傷害量+1%。 中列：衝破攻擊力+ 5% 。 後列：砲擊致命傷害量+1% 。
同時砲擊		放棄防禦，集中砲擊的特化陣形 前列：砲擊攻擊力+5%。 中列：砲擊命中+5%。 後列：砲擊致命傷害量+1% 。
神聖的保護		集中防禦與生存，集中抵抗的特化陣形 前列：衝破防禦力+ 5% 。 中列：肉搏防禦力+5%。 後列：砲擊防禦力+5%。
意志的反擊		反擊敵人攻擊的特化陣形 前列：肉搏反擊傷害量+5%。 中列：砲擊反擊傷害量+5%。 後列：砲擊反擊傷害量+5%。